疫情发生后，张严峻带领团队与时间赛跑，连续一个多月24小时不间断地进行样本检测，加速研发“防控、检测、治疗”等领域的关键技术，着力解决疫情防控工作中的关键问题。
经过不懈努力，张严峻团队在2020年1月24日成功分离到了新型冠状病毒毒株，在全国省级疾控系统中率先做到“四个第一”：第一个分离到新冠病毒毒株，分离出的毒株用于疫苗研制、药物研发、诊断试剂生产，并成功完成新冠灭活疫苗种子筛选和种子库建立；第一个获得新冠病毒全基因序列；第一个建立上线自动化全基因组检测平台，合作开发新冠病毒基因组软件MPV1.0，将原来数小时的疑似病例基因分析缩短至半小时，并精准检测出病毒的变异情况；第一个建立生物安全样本追溯系统，实现标本转运实时定位可追踪、路径可查询，为“精密智控”提供技术支撑，带领团队最早完成新冠病毒灭活疫苗临床前研究并在Science杂志上发表研究成果。
